Agroenvgeo (INRA)
Vibrisses: anomaly detection thresholds for different trace elements (RMQS)
This dataset gathers the results of the calculation of indicators that can serve as detection thresholds for trace element anomalies (arsenic, cadmium, cobalt, chromium, copper, mercury, nickel, lead, thallium, zinc) in surface soils . These indicators correspond to vibrisses calculated from a set of measurements located within a radius of 50 km around the considered point. The measurements correspond to total contents of trace elements and come from the sites of the Network of Measurements for horizons 0-30 cm (all elements) and 30-50 cm (except for arsenic and Mercury).
We consider here that these regionalized calculations of the vibrisses play a role of indicator of regional tendency taking into account both the values of pedo-geochemical bottoms and the contributions of anthropic origin. They correspond to the limit content beyond which a value can be considered as anomalous. They thus make it possible to detect punctual anomalies while avoiding the local background value.
Simple
- Date ( Creation )
- 2018-01-06
- Date ( Publication )
- 2018-01-06
- Date ( Revision )
- 2023-02-13
- Presentation form
- Digital map
- Credit
- Saby, Nicolas; Villanneau, E; Toutain, B; Arrouays, D., 2018, "Seuils de détection d’anomalies pour 8 éléments traces métalliques (RMQS)", https://doi.org/10.15454/UEZXBY, Portail Data Inra, V1
- Status
- Completed
- Maintenance and update frequency
- Not planned
- Name
- postgis
- Keywords
-
- RMQS
- Contamination
- data processing
- vibrisses
- France
- éléments traces
- statistiques
- ETM
- Use limitation
- The values provided on the anomaly detection thresholds must be handled with care. The interpretations that are made must take into account the rather frustrating nature of these indicators. Indeed, it is important to note that the calculations do not take into account local soil processes. Les valeurs fournies sur les seuils de détection d’anomalie doivent être manipulée avec précaution. Les interprétations qui en sont faites doivent ainsi tenir compte du caractère assez frustres de ces indicateurs. En effet, il est important de noter que les calculs ne prennent pas en compte les processus pédologiques locaux.
- Use limitation
- Data subject to open license CC0 – « Public Domain Dedication ». : https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/ Données soumises à une licence ouverte CC0 – « Public Domain Dedication ». : https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
- Use limitation
- Free use, subject to mentioning the source (at least the name of the producer) and the date of its last update. Utilisation libre sous réserve de mentionner la source (à minima le nom du producteur) et la date de sa dernière mise à jour.
- Access constraints
- Other restrictions
- Use constraints
- License
- Other constraints
- No restriction of public access Pas de restriction d'accès public
- Spatial representation type
- Vector
- Denominator
- 16000
- Metadata language
- fr
- Topic category
-
- Geoscientific information
- Environment
- Description
- France
))
- Reference system identifier
- http://www.opengis.net/def / EPSG:2154 /
- Topology level
- Geometry only
- Geometric object type
- Surface
- Geometric object count
- 2295
- Distribution format
-
-
postgis
(
)
-
postgis
(
)
- OnLine resource
-
vibrisses_rmqs
(
WWW:DOWNLOAD-1.0-http--download
)
Format Shapefile
- OnLine resource
-
Dataverse
(
WWW:LINK-1.0-http--link
)
Données disponibles sur le GisSol Dataverse (INRA - Institut National de la Recherche Agronomique)
- OnLine resource
-
E. Villanneau, C. Perry-Giraud, N. Saby, C. Jolivet, F. Marot, D. Maton, A. Floch-Barneaud, V. Antoni et D. Arrouays, 2008. Détection de valeurs anomaliques d’éléments traces métalliques dans les sols à l’aide du Réseau de Mesure de la Qualité des Sols. Étude et Gestion des Sols, Volume 15,3, 2008 - pages 183 à 200
(
WWW:LINK-1.0-http--link
)
Source bibliographique de la ressource
- OnLine resource
-
Programme RMQS
(
WWW:LINK-1.0-http--link
)
Présentation du programme RMQS (Réseau de Mesures de la Qualité des Sols)
- OnLine resource
-
vibrisses_as_0_30
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte de l'Arsenic à la profondeur 0-30 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_cd_0_30
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Cadmium à la profondeur 0-30 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_cd_30_50
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Cadmium à la profondeur 30-50 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_co_0_30
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Cobalt à la profondeur 0-30 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_co_30_50
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Cobalt à la profondeur 30-50 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_cr_0_30
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Chrome à la profondeur 0-30 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_cr_30_50
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Chrome à la profondeur 30-50 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_cu_0_30
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Cuivre à la profondeur 0-30 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_cu_30_50
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Cuivre à la profondeur 30-50 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_hg_0_30
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Mercure à la profondeur 0-30 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_ni_0_30
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Nickel à la profondeur 0-30 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_ni_30_50
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Nickel à la profondeur 30-50 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_pb_0_30
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Plomb à la profondeur 0-30 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_pb_30_50
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Plomb à la profondeur 30-50 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_tl_0_30
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Thalium à la profondeur 0-30 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_tl_30_50
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Thalium à la profondeur 30-50 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_zn_0_30
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Zinc à la profondeur 0-30 cm
- OnLine resource
-
vibrisses_zn_30_50
(
OGC:WMS
)
Visualiser la carte du Zinc à la profondeur 30-50 cm
- Hierarchy level
- Dataset
- Statement
- Most of the steps for the calculation of the vibrisses are realized using scripts executed in the R software (R Development Core Team, 2007). The first step consists in calculating the distance between sites. Then, the trace elements concentrations are extracted from the database. The following steps are realized for each trace element and each layer with only one R script: • Selection, for each site, of the trace elements concentrations from the neighbouring sites within a distance of 50 km, • Count the number of sites with a trace element concentration, the vibrisse calculation is done only of there are at least 10 sites, • Calculation, for each site, of the vibrisse with the following formula: v = median + 3x interquartile range. Source: E. Villanneau, C. Perry-Giraud, N. Saby, C. Jolivet, F. Marot, D. Maton, A. Floch-Barneaud, V. Antoni et D. Arrouays, 2008. Détection de valeurs anomaliques d’éléments traces métalliques dans les sols à l’aide du Réseau de Mesure de la Qualité des Sols. Étude et Gestion des Sols, Volume 15,3, 2008 - pages 183 à 200 La plupart des étapes des calculs des vibrisses sont réalisées à l’aide de scripts exécutés dans le logiciel R (R Development Core Team, 2007). La première étape est de calculer la distance entre les sites. Puis, une étape d’extraction, depuis la base de données, des concentrations en éléments traces pour chaque site est effectuée. Les étapes suivantes sont réalisées par élément trace et par couche à l’aide d’un seul script R : • Sélection, pour chaque site, des concentrations en éléments traces des sites voisins situés à une distance inférieure à 50 km, • Décompte du nombre de concentrations en éléments traces sélectionnées par site et non-calcul de vibrisse lorsque ce décompte est inférieur à 10, • Calcul, pour chaque site, de la vibrisse avec la formule suivante : v = médian + 3x l’écart interquartile. Source : E. Villanneau, C. Perry-Giraud, N. Saby, C. Jolivet, F. Marot, D. Maton, A. Floch-Barneaud, V. Antoni et D. Arrouays, 2008. Détection de valeurs anomaliques d’éléments traces métalliques dans les sols à l’aide du Réseau de Mesure de la Qualité des Sols. Étude et Gestion des Sols, Volume 15,3, 2008 - pages 183 à 200
gmd:MD_Metadata
- File identifier
- 63e6c177-455e-5805-b70b-0894ee1c7174 XML
- Metadata language
- fr
- Character set
- UTF8
- Hierarchy level
- Dataset
- Date stamp
- 2023-08-03T16:37:34
- Metadata standard name
- ISO 19115:2003/19139
- Metadata standard version
- 1.0
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